फखरुद्दीन की शुरुआती पढ़ाई गोंडा में हुई. ग्रेजुएशन दिल्ली के प्रतिष्ठित सेंट स्टीफेंस कॉलेज में. फिर वह इंग्लैंड के कैंब्रिज शहर में लॉ की पढ़ाई करने पहुंचे. यहां उनकी मुलाकात और फिर दोस्ती नेहरू से हुई. इसने उनकी आगे की जिंदगी की दिशा तय कर दी.